No menu, você tem a Configuração da Conta pessoal e a Configuração da Empresa. No caso do logo da empresa, você deve alterar nas Configurações da Empresa, na barra superior no canto direito, você tem a opção do menu, como na imagem abaixo.
Basta selecionar a opção Configurações da Empresa e selecionar seu logo.
Se você tiver qualquer dúvida, entre em contato com nosso time no Suporte! =)